Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms