Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms