Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms