Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms