Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms