Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms