Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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GTF3C6Q969F1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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GTF3C6Q969F1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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GTF3C6Q969F1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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GTF3C6Q969F1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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GTF3C6Q969F1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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GTF3C6Q969F1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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