Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMO7Q8WWI1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms