Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPBAR1Q8TDU6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms