Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX54Q8TDD1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms