Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APCDD1LQ8NCL9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms