Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC74

RBBP8NL, RBBP8 N-terminal-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8NLQ8NC74 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP8NLQ8NC74 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms