Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMBOX1Q6NT76 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms