Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms