Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALRD1Q5VYJ5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MALRD1Q5VYJ5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms