Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 VN1R11P-201ENST00000407795 868 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 AL023284.3-202ENST00000571188 543 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 KCNMB3-201ENST00000314235 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHIC1Q5VXU3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHIC1Q5VXU3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHIC1Q5VXU3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHIC1Q5VXU3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHIC1Q5VXU3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHIC1Q5VXU3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHIC1Q5VXU3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHIC1Q5VXU3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHIC1Q5VXU3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHIC1Q5VXU3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CHIC1Q5VXU3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHIC1Q5VXU3 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHIC1Q5VXU3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHIC1Q5VXU3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHIC1Q5VXU3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CHIC1Q5VXU3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHIC1Q5VXU3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHIC1Q5VXU3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHIC1Q5VXU3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHIC1Q5VXU3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHIC1Q5VXU3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHIC1Q5VXU3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHIC1Q5VXU3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHIC1Q5VXU3 ETFRF1-201ENST00000381356 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms