Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 BDNF-215ENST00000530861 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 DIAPH2-203ENST00000373049 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms