Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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KHDC3LQ587J8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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KHDC3LQ587J8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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