Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms