Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF212Q495C1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms