Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms