Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
QSER1Q2KHR3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
QSER1Q2KHR3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms