Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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GEN1Q17RS7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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