Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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