Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIST3H3Q16695 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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