Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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RPE65Q16518 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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RPE65Q16518 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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RPE65Q16518 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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RPE65Q16518 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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RPE65Q16518 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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RPE65Q16518 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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RPE65Q16518 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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RPE65Q16518 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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