Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TNXAQ16473 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TNXAQ16473 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TNXAQ16473 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TNXAQ16473 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TNXAQ16473 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TNXAQ16473 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TNXAQ16473 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TNXAQ16473 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TNXAQ16473 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TNXAQ16473 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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