Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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SSX1Q16384 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SSX1Q16384 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SSX1Q16384 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SSX1Q16384 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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SSX1Q16384 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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SSX1Q16384 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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SSX1Q16384 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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