Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms