Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USF2Q15853 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
USF2Q15853 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USF2Q15853 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
USF2Q15853 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USF2Q15853 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
USF2Q15853 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USF2Q15853 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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