Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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SYCP1Q15431 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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SYCP1Q15431 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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