Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms