Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms