Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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