Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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