Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms