Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB2A2Q13296 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms