Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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