Protein–RNA interactions for Protein: Q13206

DDX10, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX10Q13206 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DDX10Q13206 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX10Q13206 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX10Q13206 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX10Q13206 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX10Q13206 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX10Q13206 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX10Q13206 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX10Q13206 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX10Q13206 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX10Q13206 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX10Q13206 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX10Q13206 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX10Q13206 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX10Q13206 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX10Q13206 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX10Q13206 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX10Q13206 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX10Q13206 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX10Q13206 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX10Q13206 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms