Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 CASC3-210ENST00000584997 543 ntTSL 310.78□□□□□ -0.684e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 TOMM5-204ENST00000540941 3071 ntTSL 1 (best)10.69□□□□□ -0.74e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 ELP2-215ENST00000540799 381 ntTSL 310.65□□□□□ -0.74e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 TPTE-204ENST00000618007 2150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.714e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 AL513165.2-202ENST00000541804 1514 ntTSL 1 (best)10.59□□□□□ -0.714e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CEP57L1-219ENST00000522490 861 ntTSL 310.23□□□□□ -0.774e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 BABAM1-209ENST00000598382 424 ntTSL 210.06□□□□□ -0.84e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 SPTBN1-201ENST00000333896 9075 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.84e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 TPTE-202ENST00000612746 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.84e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CCDC88A-202ENST00000336838 9505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.84e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 ELP2-210ENST00000539560 2542 ntTSL 1 (best)10□□□□□ -0.814e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 PUM1-208ENST00000471894 812 ntTSL 39.96□□□□□ -0.824e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 PUM1-210ENST00000490546 707 ntTSL 49.83□□□□□ -0.844e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 DOCK2-217ENST00000540750 1753 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.844e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CEP57L1-207ENST00000518853 813 ntTSL 39.76□□□□□ -0.854e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 MICU1-205ENST00000476605 1933 ntTSL 29.67□□□□□ -0.864e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 PPIL4-201ENST00000253329 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.868e-7■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CNOT2-229ENST00000551179 355 ntTSL 29.6□□□□□ -0.874e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CNOT2-243ENST00000553078 440 ntTSL 39.6□□□□□ -0.874e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 SEL1L-201ENST00000336735 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.894e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 TPTE-201ENST00000427445 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.914e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 AF254983.1-201ENST00000612267 3336 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.924e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 ELP2-203ENST00000358232 8459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.924e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CEP57L1-222ENST00000523209 866 ntTSL 59.2□□□□□ -0.944e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 ELP2-205ENST00000442325 2722 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.944e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 ZNF780A-206ENST00000595687 3472 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.954e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 ZNF780A-201ENST00000340963 3674 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.974e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CEP57L1-202ENST00000368968 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.984e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.994e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CEP57L1-205ENST00000517392 2771 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.994e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CTNNA1-203ENST00000517534 416 ntTSL 28.6□□□□□ -1.034e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CLASP1-212ENST00000480007 569 ntTSL 48.54□□□□□ -1.044e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CLASP1-207ENST00000452274 3966 ntTSL 58.53□□□□□ -1.044e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 MICU1-206ENST00000489666 579 ntTSL 48.4□□□□□ -1.064e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 MICU1-204ENST00000418483 1212 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.074e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 ZNF780A-202ENST00000414720 2396 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.084e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.094e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 AC005614.2-201ENST00000595508 461 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.094e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 PUM1-223ENST00000532678 793 ntTSL 48.07□□□□□ -1.124e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CDK1-203ENST00000395284 1913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.134e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CTNNA1-210ENST00000518825 3536 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.134e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 MICU1-203ENST00000398763 1224 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.134e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CLASP1-206ENST00000449975 555 ntTSL 47.76□□□□□ -1.174e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.174e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 PSMA2-205ENST00000457444 801 ntTSL 37.64□□□□□ -1.194e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 DOCK2-216ENST00000524185 5656 ntTSL 1 (best)7.54□□□□□ -1.24e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CCDC88A-206ENST00000430086 582 ntTSL 37.41□□□□□ -1.224e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CEP57L1-214ENST00000521277 3832 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.254e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 RMDN1-211ENST00000519789 728 ntTSL 37.22□□□□□ -1.254e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CLASP1-211ENST00000474065 516 ntTSL 37.19□□□□□ -1.264e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CLASP1-205ENST00000430234 582 ntTSL 46.65□□□□□ -1.344e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.354e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 RMDN1-204ENST00000517710 898 ntTSL 36.5□□□□□ -1.374e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CDK1-207ENST00000519078 723 ntTSL 36.34□□□□□ -1.394e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 RMDN1-213ENST00000520719 557 ntTSL 36.32□□□□□ -1.44e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 ELP2-224ENST00000543861 555 ntTSL 46.03□□□□□ -1.444e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.454e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 RMDN1-216ENST00000522942 557 ntTSL 35.93□□□□□ -1.464e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CLASP1-204ENST00000418989 663 ntTSL 45.84□□□□□ -1.474e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CEP57L1-212ENST00000520761 865 ntTSL 55.84□□□□□ -1.474e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 RMDN1-210ENST00000519639 562 ntTSL 35.68□□□□□ -1.54e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 ZNF780A-211ENST00000601715 446 ntTSL 25.67□□□□□ -1.54e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 DENND1B-210ENST00000496935 2137 ntTSL 25.48□□□□□ -1.534e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 AC112178.1-202ENST00000446720 427 ntTSL 35.34□□□□□ -1.554e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.564e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.564e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 ZNF780A-208ENST00000599368 665 ntTSL 25.12□□□□□ -1.594e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 ANGPT1-207ENST00000521950 1177 ntTSL 1 (best)5□□□□□ -1.614e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 RMDN1-205ENST00000517821 407 ntTSL 24.96□□□□□ -1.624e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CDK1-206ENST00000487784 598 ntTSL 54.71□□□□□ -1.664e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.664e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 ELP2-219ENST00000542050 690 ntTSL 34.16□□□□□ -1.744e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 OSBPL3-213ENST00000461835 306 ntTSL 24.12□□□□□ -1.754e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 ZNF780A-210ENST00000601688 467 ntTSL 1 (best)3.9□□□□□ -1.794e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.824e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.824e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.894e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.924e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.094e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.922e-8■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.432e-8■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 RPS10-NUDT3-202ENST00000639725 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 RPS10-NUDT3-203ENST00000639877 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.892e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 RPS10-NUDT3-201ENST00000605528 595 ntTSL 56.93□□□□□ -1.32e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.571e-9■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 PSMD6-205ENST00000475036 1045 ntTSL 317.31■□□□□ 0.361e-9■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 PSMD6-212ENST00000497323 717 ntTSL 516.2■□□□□ 0.181e-9■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.181e-9■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 PSMD6-206ENST00000476464 2052 ntTSL 215.6■□□□□ 0.091e-9■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 PSMD6-209ENST00000482510 1176 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.421e-9■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 PSMD6-207ENST00000478185 469 ntTSL 510.98□□□□□ -0.651e-9■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.541e-9■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 PCNP-207ENST00000498274 786 ntTSL 219.05■□□□□ 0.643e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.395e-7■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 HYOU1-215ENST00000543287 2464 ntTSL 216.9■□□□□ 0.35e-7■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.193e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.225e-7■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 HYOU1-207ENST00000530473 2023 ntTSL 513.44□□□□□ -0.265e-7■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 PCNP-202ENST00000460231 2165 ntTSL 1 (best)13.3□□□□□ -0.283e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.285e-7■■■■□ 19.5
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