Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CHAF1BQ13112 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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