Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2AQ12879 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
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