Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms