Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms