Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIN1Q05586 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIN1Q05586 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIN1Q05586 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIN1Q05586 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIN1Q05586 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIN1Q05586 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIN1Q05586 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIN1Q05586 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIN1Q05586 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIN1Q05586 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIN1Q05586 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIN1Q05586 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIN1Q05586 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIN1Q05586 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GRIN1Q05586 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIN1Q05586 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIN1Q05586 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIN1Q05586 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIN1Q05586 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIN1Q05586 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIN1Q05586 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIN1Q05586 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIN1Q05586 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRIN1Q05586 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIN1Q05586 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIN1Q05586 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIN1Q05586 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIN1Q05586 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIN1Q05586 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRIN1Q05586 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIN1Q05586 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRIN1Q05586 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIN1Q05586 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIN1Q05586 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRIN1Q05586 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIN1Q05586 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIN1Q05586 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIN1Q05586 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIN1Q05586 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIN1Q05586 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIN1Q05586 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms