Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms