Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms