Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMF1P82094 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMF1P82094 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMF1P82094 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMF1P82094 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMF1P82094 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMF1P82094 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMF1P82094 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMF1P82094 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMF1P82094 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMF1P82094 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMF1P82094 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMF1P82094 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMF1P82094 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMF1P82094 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMF1P82094 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMF1P82094 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMF1P82094 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMF1P82094 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMF1P82094 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMF1P82094 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMF1P82094 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMF1P82094 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMF1P82094 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMF1P82094 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMF1P82094 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMF1P82094 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMF1P82094 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMF1P82094 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMF1P82094 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMF1P82094 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMF1P82094 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMF1P82094 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TMF1P82094 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMF1P82094 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMF1P82094 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMF1P82094 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMF1P82094 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMF1P82094 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMF1P82094 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMF1P82094 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMF1P82094 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TMF1P82094 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TMF1P82094 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMF1P82094 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMF1P82094 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMF1P82094 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMF1P82094 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMF1P82094 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMF1P82094 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMF1P82094 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMF1P82094 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMF1P82094 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMF1P82094 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMF1P82094 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMF1P82094 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMF1P82094 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMF1P82094 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMF1P82094 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMF1P82094 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMF1P82094 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMF1P82094 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMF1P82094 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMF1P82094 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMF1P82094 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMF1P82094 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMF1P82094 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMF1P82094 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMF1P82094 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMF1P82094 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMF1P82094 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMF1P82094 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms