Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HBBP68871 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HBBP68871 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HBBP68871 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HBBP68871 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HBBP68871 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HBBP68871 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HBBP68871 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HBBP68871 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HBBP68871 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HBBP68871 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
HBBP68871 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HBBP68871 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HBBP68871 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HBBP68871 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HBBP68871 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HBBP68871 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HBBP68871 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HBBP68871 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HBBP68871 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HBBP68871 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HBBP68871 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HBBP68871 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HBBP68871 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HBBP68871 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HBBP68871 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
HBBP68871 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HBBP68871 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
HBBP68871 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HBBP68871 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms