Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-24P63145 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms